Abstract

CALVO, Laia; CORTEY, Martí; GARCIA-MARIN, Jose-Luís  and  GARCIA-GIL, L. Jesús. Análisis poligénico de cepas de bacterias oxidadoras de amoníaco por medio de los genes 16S rDNA, amoA y amoB. INT. MICROBIOL. [online]. 2005, vol.8, n.2, pp.103-110. ISSN 1139-6709.

Encontrar un marcador molecular único capaz de proporcionar rápidamente información filogenética rigurosa y útil facilitaría evaluación de la diversidad de las bacterias oxidadoras de amoníaco en muestras ambientales. En esta clase de estudios no se puede utilizar simultáneamente más que uno de los marcadores disponibles. Los genes 16S rDNA, amoA y amoB se evaluaron individualmente para identificar el que se ajusta mejor a la información proporcionada por el conjunto de datos de los tres genes. Se compararon los árboles de Neighbor-Joining, basados en las distancias, y los árboles de máxima parsimonia basados en las secuencias conocidas de los tres genes mencionados, y se analizaron en relación con los árboles poligénicos construidos con la información combinada proporcionada por los tres genes. Los árboles de máxima parsimonia resultaron más fieles que los basados en las distancias, y la topología poligénica era la que mejor se ajustaba a la información contenida en las secuencias. Sin embargo, la información taxonómica y filogenética proporcionada por los tres marcadores por separado también resultó válida. Por tanto, cualquiera de los dos marcadores funcionales (amoA o amoB) se puede utilizar para detectar los oxidantes del amoníaco en estudios ambientales en los que solamente puede usarse un gen.

Keywords : bacterias oxidadoras de amoníaco; 16S rDNA; amoA; amoB; análisis poligénico.

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