Abstract

GRIFFITHS, Emma  and  GUPTA, Radhey S.. As seqüências assinaturas de diversas proteínas demonstram a divergência tardia da Ordem Aquificales. INT. MICROBIOL. [online]. 2004, vol.7, n.1, pp.41-52. ISSN 1139-6709.

Atualmente acredita-se que as espécies de Aquificales são as que primeiro se separaram dentro do dominio Bacteria. No entanto, a ordem de ramificação deste grupo não está resolvida e é altamente variável nas diferentes árvores filogenéticas. Neste trabalho foi examinada a posição filogenética de Aquificales mediante uma aproximação cladística baseada na presença ou ausência compartilhada de seqüências com assinaturas definidas (representando adições ou deleções conservadas), encontradas em muitas proteinas importantes e altamente conservadas como são a RNA polimerase β (RpoB), a RNA polimerase β' (RpoC), a alanil-tRNA sintetase (AlaRS), a CTP sintase, a pirosfosfatase inorgβnica (PPase), Hsp 70 e Hsp60. Com esse obtetivo foram clonados fragmentos dos genes das proteνnas enumeradas e que continham as regiυes assinatura provenientes de diferentes espιcies de Aquificales (Calderobacterium hydrogenophilum, Hydrogenobacter marinus e Thermocrinis ruber) e comparadas as seqüências com as disponíveis para as demais espécies. A presença de inserções distintas nas proteínas Hsp70 e Hsp60 das espécies de Aquificales as quais não foram encontrados em nenhuma espécie de Firmicutes, Actinobactérias ou Thermotoga-Clostridium, exclue estes grupos do domínio Bacteria. A presença compartilhada de importantes inserções-deleções nas proteínas RpoB (>100 aa), RpoC (>100 aa) e AlaRS (4 aa) em várias espécies de Aquificales assim como de Clamídeas, o grupo CFBG (Cytophaga-Flavobactérias-Bacteroides-Bactérias verdes do enxofre) e as Proteobactérias indica fortemente a inserção dessas espécies nos grupos de Bacteria. Uma adição de 2 aa na pirofosfatase inorgânica, presente unicamente nos genes homólogos de Aquificales e Proteobactérias, parece indicar uma relação específica entre estes dois filos. Entretanto, as espécies de Aquificales não possuem assinatura em algumas proteínas (por exemplo, os indels em CTP sintase e Hsp70) que são características das Proteobactérias indicando que elas constituem um filo distinto, embora relacionado com as Proteobactérias. Estes resultados representam uma forte e consistente evidência de que os Aquificales se divergiram depois da ramificação dos Firmicutes, Actinobactérias, Thermotoga, Deinococcus-Thermus, Bactérias verdes do enxofre, Cianobactérias, Espioquetas e os grupos Clamídeas-CFBG, porém antes do surgimento das Proteobactérias.

Keywords : Aquifex; filogenia bacteriana; ordem de ramificação.

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