Abstract

CALVO, Laia; CORTEY, Martí; GARCIA-MARIN, Jose-Luís  and  GARCIA-GIL, L. Jesús. Análise poligénico de cepas de bactérias oxidadoras de amoníaco através dos genes 16S rDNA, amoA e amoB. INT. MICROBIOL. [online]. 2005, vol.8, n.2, pp.103-110. ISSN 1139-6709.

Encontrar um marcador molecular único capaz de proporcionar rapidamente informação filogenética rigorosa e útil facilitaria avaliação da diversidade das bactérias oxidadoras de amoníaco em amostras ambientais. Nesta classe de estudos não é possível utilizar simultaneamente mais que um dos marcadores disponíveis. Os genes 16S rDNA, amoA e amoB foram avaliadas individualmente para identificar o que se ajusta melhor à informação proporcionada pelo conjunto de dados dos três genes. Foram comparadas as árvores filogenéticas de Neighbor-Joining, baseadas nas distâncias, e as árvores de máxima parcimônia baseadas nas seqüências conhecidas dos três genes mencionados, e foram analisadas em relação com as árvores poligénicas construídas com a informação combinada proporcionada pelos três genes. As árvores de máxima parcimônia resultaram mais fiéis que as baseadas nas distâncias, e a topologia poligénica foi a que melhor se ajustou à informação contida nas seqüências. No entanto, a informação taxonômica e filogenética proporcionada pelos três marcadores separadamente também resultou válida. Portanto, qualquer dos dois marcadores funcionais (amoA ou amoB) pode-se utilizar para detectar os oxidantes do amoníaco em estudos ambientais nos quais somente pode-se usar um gene.

Keywords : bacterias oxidadoras de amoníaco; 16S rDNA; amoA; amoB; análise poligénico.

        · abstract in English | Spanish     · text in English     · English ( pdf )