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Nutrición Hospitalaria

versión On-line ISSN 1699-5198versión impresa ISSN 0212-1611

Resumen

YAO, Kunpeng et al. Posible mecanismo molecular de la cápsula Xiexin en la intervención de la dislipidemia basada en la bioinformática y el acoplamiento molecular. Nutr. Hosp. [online]. 2022, vol.39, n.3, pp.569-579.  Epub 17-Oct-2022. ISSN 1699-5198.  https://dx.doi.org/10.20960/nh.03918.

Objetivo:

se utilizaron métodos bioinformáticos y técnicas de acoplamiento molecular para predecir los componentes efectivos, los objetivos y las vías biológicas relacionadas de la cápsula Xiexin en la intervención de la dislipidemia y explorar su mecanismo.

Métodos:

los componentes activos y los objetivos de la cápsula Xiexin fueron seleccionados por la base de datos TCMSP. Se utilizaron las plataformas Genecards, OMIM, PharmGkb, TTD (Therapeutic Target Database) y Drugbank para buscar las dianas de la enfermedad en la dislipidemia. El diagrama reticular “componente-diana” fue construido por el software Cytoscape 3.7.0, y la interacción proteína-proteína (PPI) fue analizada por la plataforma STRING. Los análisis de enriquecimiento de Gene Ontology (GO) y Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomics (KEGG) se realizaron mediante paquetes de datos en lenguaje R para predecir el mecanismo de acción. El software AutoDockVina y PyMol se utilizó para unir los componentes activos clave de la cápsula Xiexin y las proteínas clave de la PPI.

Resultados:

se seleccionaron 65 componentes activos y 114 dianas. Veintitrés compuestos activos clave fueron seleccionados a partir de la tabla “componentes farmacéuticos-dianas”. Las redes PPI incluyen principalmente proteínas básicas como PTGS2, PTGS1 y HSP90AA1. Los resultados del análisis de enriquecimiento de GO y KEGG en los objetivos comunes se refieren principalmente a la vía de señalización mediada por esteroides, la respuesta hormonal esteroidea, el transporte y metabolismo lipídicos, la regulación del almacenamiento de colesterol, la vía de la ciclooxigenasa y otras vías biológicas, así como la vía de señalización de PPAR, la vía de señalización de IL-17, la vía de señalización de PI3K-Akt, la vía de señalización de FcnnnnnnnnRI y otras vías relacionadas. La prueba de acoplamiento molecular mostró que la quercetina se une mejor a la proteína diana central HSP90AA1, que es la proteína diana con la mejor actividad de unión de los componentes químicos clave de la cápsula Xiexin.

Conclusión:

los principales componentes químicos de la cápsula Xiexin pueden participar en la regulación de la PPAR y otras vías de señalización mediante la regulación de genes clave como ESR1, MAPK14 (mitogen-activated protein kinase 14), HSP90AA1, por lo que pueden desempeñar un papel farmacológico en la intervención de la dislipidemia.

Palabras clave : Cápsula Xiexin; Dislipidemia; Bioinformática; Mecanismo molecular.

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